近年来，随着高通量测序技术的不断发展，低深度全基因组测序（CNV-seq）和产前外显子组测序（prenatal Exome Sequencing，pES）技术已广泛应用于产前诊断领域。

　　目前国内最大规模的CNV-seq联合pES产前临床回顾性研究表明，CNV-seq联合pES一次性精准检测包括染色体非整倍体、拷贝数变异、InDels、SNVs在内的多种变异类型[1]，是近乎全基因组检测效能的产前诊断解决方案，在显著提升产前诊断效率的同时可以有效缓解孕妇的焦虑。

　　本文分享两例采用CNV-seq联合pES同时对胎儿进行染色体病和单基因病的产前诊断案例。

　　CNV-seq&pES助力高效产前诊断

　　临床案例一

　　临床信息

　　孕妇27岁，G2P1，孕19周+1天。胎儿B超结果显示：NT增厚4.3mm，颈部囊性团块，淋巴水囊瘤，躯干皮肤增厚，鼻骨隐约可见。

　　诊断方法

　　行羊膜腔穿刺术采集羊水样本进行CNV-seq检测，同时对羊水样本及胎儿父母外周血样本进行家系pES检测。

　　检测结果

　　SNVs及InDels结果：胎儿样本检测到基因RAF1的1个变异，判读为致病：

　　表1.SNVs及InDels检测结果

　　图1.一代验证结果

　　疾病小贴士：Noonan综合征为仅次于21-三体综合征的常见合并先天性心脏缺陷的综合征，主要表现为特殊面容、先天性心脏病、身材矮小、颈蹼、胸廓畸形、视力异常、听力损失、发育迟缓、喂养困难、隐睾等[2]。Noonan综合征是由丝裂原活化蛋白激酶（Ras/mitogen activated protein kinase，Ras/MAPK）信号通路中的相关基因突变导致该通路信号转导增加引起的，该疾病具有遗传异质性，目前已报道至少有16个基因与Noonan综合征相关。本案例中检出的RAF1基因c.770C>T（p.Ser257Leu）错义突变是Noonan综合征的热点突变，该突变下调第259位丝氨酸残基的磷酸化水平，进而解除其对Raf-1蛋白活性的抑制，影响了 Ras/MAPK信号通路[3]。

　　胎儿CNV-seq结果显示未见异常

　　图2.CNV-seq检测结果图

　　经充分地遗传咨询后，孕妇选择终止妊娠。

　　临床案例二

　　临床信息

　　孕妇32周岁，G2P1，孕18周+1天。胎儿B超结果显示：NT增厚3.3mm，鼻骨未显示，脉络丛囊肿（胎儿右侧）；胎儿父亲携带有β-地贫突变位点，基因型为βCD17/βN。

　　疾病小贴士：正常个体的β-珠蛋白基因型为βN/βN，基因型为β CD17/βN的个体是指其中1个β-珠蛋白基因发生了CD17突变，该突变属于无义突变，是中国南方人群中常见的β地贫突变类型之一[4]，可导致终止密码子TAG形成，影响β-珠蛋白基因的正常转录，使得β链无法合成。携带有该突变位点的个体为非患病个体，无临床症状且无需治疗[5]。

　　诊断方法

　　行羊膜腔穿刺术采集羊水样本进行CNV-seq检测，同时对羊水样本及胎儿父母外周血样本进行家系pES检测。

　　检测结果

　　SNVs及InDels结果：胎儿样本和父亲样本检测到基因HBB的1个变异，判读为致病：

　　表2.SNVs及InDels检测结果

　　图3.一代验证结果

　　疾病小贴士：胎儿及其父亲检测到的基因变异位点NM_000518.5:exon1:c.52A>T:p.K18*即为CD17突变，即胎儿携带有和父亲相同的β-地贫突变位点，地贫基因型均为βCD17/βN。

　　胎儿及其父母样本的外显子组测序分析结果提示胎儿存在21号染色体三体，父亲和母亲正常。经CNV-seq检测结果验证，胎儿为21号染色体三体。

　　表3.CNV-seq检测结果

　　图4.CNV-seq检测结果图

　　经充分地遗传咨询后，孕妇选择终止妊娠。

　　案例思考

　　以上两个案例中，孕期B超结果均显示胎儿NT增厚。NT增厚（NT≥3.0mm）是孕期筛查胎儿异常的重要指标。对于 NT增厚胎儿，其罹患染色体病和努南综合征等单基因病的风险增加[6]，建议同时对胎儿进行染色体病和单基因病的产前诊断。同时，中晚孕期出现胎儿鼻骨发育异常和非孤立性脉络丛囊肿均属于产前诊断指征，应及时进行产前诊断以避免出生缺陷患儿的出生[7]。

　　两名孕妇均选择CNV-seq和家系pES检测技术同时进行产前诊断，一次性精准检测包括染色体非整倍体、拷贝数变异、InDels、SNVs等多种变异类型，更快地获知了更加全面的检测结果，有利于及时进行决策，产前诊断效率大幅提升。

　　贝瑞基因（000710）CNV-seq&pES CNV-seq联合pES检测最快9个工作日即可出具报告，满足临床刚性需求，高效助力出生缺陷精准防控。

　　结语

　　我国出生缺陷总发生率约为5.6%，每年新增出生缺陷患儿约90万例[8]，给家庭和社会带来了沉重负担。随着当下我国高龄孕妇比例的持续攀升，子代罹患出生缺陷的风险也在持续增加，防控形势愈加严峻。作为我国出生缺陷三级防控体系中的重要环节，产前诊断技术在近年来不断发展。2024年，CNV-seq检测试剂盒和软件正式获批，标志着CNV-seq历经多年临床实践证明，获得了临床和患者的高度认可，已成为符合我国国情的一线产前诊断技术。pES作为产前诊断领域的前沿技术，能够深入到单基因病层面为孕妇提供精准的病因诊断。二者联合应用可大幅提升产前诊断效率，有效助力出生缺陷防控。

　　贝瑞基因始终致力于向临床提供更加精准、高效的产前诊断解决方案，为我国出生缺陷防治工作高质量发展提供坚实的技术支撑和保障。